LOCUS pTEI044_[Pro+5Uf]_pRPS5a_AT3G11940 3908 bp DNA circular UNA 23-OCT-2012 COMMENT This file is created by Vector NTI http://www.invitrogen.com/ FEATURES Location/Qualifiers misc_feature join(3610..3908,1..316) /vntifkey="21" /label="rep (pMB1)" rep_origin complement(301) /vntifkey="33" /label="ORI" /note="RNaseH cleavage point" primer 409..428 /label="JS836" gene <549..1728 /gene="HST" /locus_tag="AT3G11945" /gene_synonym="ATHST" /gene_synonym="homogentisate prenyltransferase" /gene_synonym="HST" /gene_synonym="PDS2" /gene_synonym="PHYTOENE DESATURATION 2" /note="Encodes a protein involved in plastoquinone-9 biosynthesis. The enzyme possesses homogentisate prenyltransferase activity and was shown to use solanesyl diphosphate, farnesyl diphosphate and geranylgeranyldiphosphate as prenyl donors, but not phytyldiphosphate. This gene At3g11945 derives from a split of At3g11950, publications Tian et al (2007) and Sadre et al (2006) refer to this gene as At3g11950." /db_xref="TAIR:AT3G11945" promoter 553..2209 /label="RPS5a promoter fragment" CDS join(579..671,828..945,1121..1183,1327..1359,1452..1526) /gene="HST" /locus_tag="AT3G11945" /gene_synonym="ATHST" /gene_synonym="homogentisate prenyltransferase" /gene_synonym="HST" /gene_synonym="PDS2" /gene_synonym="PHYTOENE DESATURATION 2" /inference="Similar to RNA sequence,EST:INSD:EL101308.1,INSD:EH843844.1,INSD:EL196767 .1,INSD:EL077181.1,INSD:EL201897.1,INSD:EH976904.1,INSD:EL 102849.1,INSD:EL214489.1,INSD:EL337352.1,INSD:AV520865.1,I NSD:EL333171.1,INSD:EL339239.1,INSD:EH853379.1,INSD:EL1283 59.1,INSD:EL283604.1,INSD:EH849368.1,INSD:EL114660.1,INSD: EL137732.1,INSD:EL971614.1,INSD:EH974687.1,INSD:EL178242.1 ,INSD:EL218085.1,INSD:EL019691.1,INSD:EL097155.1,INSD:EH92 2883.1,INSD:EH990755.1,INSD:EL335191.1,INSD:BP787367.1,INS D:EG510418.1,INSD:EH932133.1,INSD:EH815304.1,INSD:EL088692 .1,INSD:AV535920.1,INSD:EL148405.1,INSD:AV535532.1,INSD:EH 918381.1,INSD:EH904454.1,INSD:EL149599.1,INSD:EL989313.1,I NSD:EH985432.1,INSD:ES001574.1,INSD:AV527881.1,INSD:EL2090 60.1,INSD:ES188722.1,INSD:EL034234.1,INSD:EL214454.1,INSD: BP787076.1,INSD:EH845200.1,INSD:EL161322.1,INSD:EL321585.1 ,INSD:EL028080.1,INSD:EL086893.1,INSD:EL297922.1,INSD:EH86 0457.1,INSD:EL233381.1,INSD:EL006902.1,INSD:EL202450.1,INS D:EH934163.1,INSD:EL261233.1,INSD:EL304903.1" /note="homogentisate prenyltransferase (HST); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UbiA prenyltransferase (InterPro:IPR000537); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: homogentisate phytyltransferase 1 (TAIR:AT2G18950.1); Has 1367 Blast hits to 1364 proteins in 371 species: Archae - 252; Bacteria - 598; Metazoa - 1; Fungi - 4; Plants - 199; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 313 (source: NCBI BLink); GO_component: GO:0009941 - chloroplast envelope [Evidence IDA] [PMID 17569077]; GO_function: GO:0010355 - homogentisate farnesyltransferase activity [Evidence IDA] [PMID 16989822]; GO_function: GO:0010356 - homogentisate geranylgeranyltransferase activity [Evidence IDA] [PMID 16989822]; GO_function: GO:0010357 - homogentisate solanesyltransferase activity [Evidence IDA] [PMID 16989822]; GO_process: GO:0010236 - plastoquinone biosynthetic process [Evidence IMP] [PMID 16989822]" /codon_start=1 /product="homogentisate prenyltransferase" /protein_id="AEE75126.1" /db_xref="GI:332641605" /db_xref="TAIR:AT3G11945" /translation="MELSISQSPRVRFSSLAPRFLAASHHHRPSVHLAGKFISLPRDV RFTSLSTSRMRILAVALTFKSRCVYVNYEIPKDQILVGAAESDDPVLDRIARFQNACW RFLRPHTIRGTALGSTALVTRALIENTHLIKWSLVLKALSGLLALICGNGYIVGINQI YDIGIDKVNKPYLPIAAGDLSVQSAWLLVIFFAIAGLLVVGFNFGPFITSLYSLGLFL GTIYSVPPLRMKRFPVAAFLIIATVRGFLLNFGVYHATRAALGLPFQWSAPVAFITSF VTLFALVIAITKDLPDVEGDRKFQISTLATKLGVRNIAFLGSGLLLVNYVSAISLAFY MPQVFRGSLMIPAHVILASGLIFQTWVLEKANYTKEAISGYYRFIWNLFYAEYLLFPF L" mRNA join(579..671,828..945,1121..1183,1327..1359,1452..1728) /gene="HST" /locus_tag="AT3G11945" /gene_synonym="ATHST" /gene_synonym="homogentisate prenyltransferase" /gene_synonym="HST" /gene_synonym="PDS2" /gene_synonym="PHYTOENE DESATURATION 2" /product="homogentisate solanesyltransferase" /inference="Similar to RNA sequence,EST:INSD:EL101308.1,INSD:EH843844.1,INSD:EL196767 .1,INSD:EL077181.1,INSD:EL201897.1,INSD:EH976904.1,INSD:EL 102849.1,INSD:EL214489.1,INSD:EL337352.1,INSD:AV520865.1,I NSD:EL333171.1,INSD:EL339239.1,INSD:EH853379.1,INSD:EL1283 59.1,INSD:EL283604.1,INSD:EH849368.1,INSD:EL114660.1,INSD: EL137732.1,INSD:EL971614.1,INSD:EH974687.1,INSD:EL178242.1 ,INSD:EL218085.1,INSD:EL019691.1,INSD:EL097155.1,INSD:EH92 2883.1,INSD:EH990755.1,INSD:EL335191.1,INSD:BP787367.1,INS D:EG510418.1,INSD:EH932133.1,INSD:EH815304.1,INSD:EL088692 .1,INSD:AV535920.1,INSD:EL148405.1,INSD:AV535532.1,INSD:EH 918381.1,INSD:EH904454.1,INSD:EL149599.1,INSD:EL989313.1,I NSD:EH985432.1,INSD:ES001574.1,INSD:AV527881.1,INSD:EL2090 60.1,INSD:ES188722.1,INSD:EL034234.1,INSD:EL214454.1,INSD: BP787076.1,INSD:EH845200.1,INSD:EL161322.1,INSD:EL321585.1 ,INSD:EL028080.1,INSD:EL086893.1,INSD:EL297922.1,INSD:EH86 0457.1,INSD:EL233381.1,INSD:EL006902.1,INSD:EL202450.1,INS D:EH934163.1,INSD:EL261233.1,INSD:EL304903.1" /db_xref="TAIR:AT3G11945" gene 2061..>2209 /gene="RPS5A" /locus_tag="AT3G11940" /gene_synonym="AML1" /gene_synonym="ARABIDOPSIS MINUTE-LIKE 1" /gene_synonym="ATRPS5A" /gene_synonym="MEC18.11" /gene_synonym="ribosomal protein 5A" /gene_synonym="RPS5A" /note="One of two genes encoding the ribosomal protein S5. Mutants have semi-dominant developmental phenotypes. Most cell-division processes are delayed or disturbed in the heterozygous mutant, and development is completely arrested at an early embryonic stage in the homozygous mutant." /db_xref="TAIR:AT3G11940" mRNA 2061..2125 /gene="RPS5A" /locus_tag="AT3G11940" /gene_synonym="AML1" /gene_synonym="ARABIDOPSIS MINUTE-LIKE 1" /gene_synonym="ATRPS5A" /gene_synonym="MEC18.11" /gene_synonym="ribosomal protein 5A" /gene_synonym="RPS5A" /product="40S ribosomal protein S5-2" /inference="Similar to RNA sequence,EST:INSD:CB257800.1,INSD:BP661979.1,INSD:EL970714 .1,INSD:DR291053.1,INSD:BP585894.1,INSD:DR291047.1,INSD:BP 837727.1,INSD:CB258928.1,INSD:BP574779.1,INSD:ES077896.1,I NSD:DR291093.1,INSD:EH885393.1,INSD:DR291046.1,INSD:ES1049 71.1,INSD:BP617461.1,INSD:BP833389.1,INSD:ES003648.1,INSD: EL999042.1,INSD:BP663224.1,INSD:BP834980.1,INSD:EL336270.1 ,INSD:EL233744.1,INSD:DR291064.1,INSD:DR291052.1,INSD:EL30 0221.1,INSD:ES160988.1,INSD:AV565182.1,INSD:EL102359.1,INS D:AA712994.1,INSD:BP670521.1,INSD:ES200172.1,INSD:BP587074 .1,INSD:ES210962.1,INSD:DR291057.1,INSD:ES169037.1,INSD:EL 972330.1,INSD:BE520183.1,INSD:EH814841.1,INSD:BP584664.1,I NSD:BP622644.1,INSD:DR291098.1,INSD:BP842821.1,INSD:BP8681 59.1,INSD:ES215433.1,INSD:EL193753.1,INSD:EL063744.1,INSD: DR291095.1,INSD:EL027305.1,INSD:AV520490.1,INSD:BP814821.1 ,INSD:EH893935.1,INSD:ES078009.1,INSD:EL070246.1,INSD:ES12 7433.1,INSD:EL972406.1,INSD:EL085166.1,INSD:BP856753.1,INS D:BP670932.1,INSD:BP572454.1,INSD:EL195401.1,INSD:BP566336 .1,INSD:ES076214.1,INSD:BP814616.1,INSD:CB261407.1,INSD:BP 629625.1,INSD:AV539002.1,INSD:AV545161.1,INSD:EG440267.1,I NSD:ES129692.1,INSD:EL314195.1,INSD:BP819578.1,INSD:ES1312 01.1,INSD:ES197993.1,INSD:DR291108.1,INSD:EL978525.1,INSD: BP817964.1,INSD:EH868174.1,INSD:ES002261.1,INSD:EL271404.1 ,INSD:DR291029.1,INSD:EL187611.1,INSD:EL224473.1,INSD:ES02 8886.1,INSD:EH914926.1,INSD:ES117736.1,INSD:EG440268.1,INS D:EL974223.1,INSD:DR291083.1,INSD:ES093392.1,INSD:EL031787 .1,INSD:BP854082.1,INSD:BP791147.1,INSD:ES188941.1,INSD:EL 097289.1,INSD:EH832661.1,INSD:BP813001.1,INSD:EL272851.1,I NSD:BP594727.1,INSD:BP590497.1,INSD:BP840394.1,INSD:ES0832 10.1,INSD:ES070764.1,INSD:EL976017.1,INSD:AV542246.1,INSD: ES210796.1,INSD:EH900717.1,INSD:EL979201.1,INSD:AV533693.1 ,INSD:DR290474.1,INSD:DR291036.1,INSD:EH980822.1,INSD:BP85 6706.1,INSD:BP848155.1,INSD:ES180935.1,INSD:EL113228.1,INS D:ES055662.1,INSD:DR291041.1,INSD:BP850327.1,INSD:DR291088 .1,INSD:DR291040.1,INSD:DR291062.1,INSD:AV552979.1,INSD:DR 291043.1,INSD:BP847714.1,INSD:AV552955.1,INSD:DR291050.1,I NSD:EL247325.1,INSD:ES165579.1,INSD:EH958234.1,INSD:EH9851 28.1,INSD:AV553086.1,INSD:AV530291.1,INSD:DR291102.1,INSD: AV551342.1,INSD:ES063415.1,INSD:BP643895.1,INSD:EL309705.1 ,INSD:EL200550.1,INSD:ES109293.1,INSD:EL204482.1,INSD:EL08 6755.1,INSD:ES001407.1,INSD:ES167252.1,INSD:EL290441.1,INS D:BP565337.1,INSD:EH928597.1,INSD:AV520567.1,INSD:EL167764 .1,INSD:DR291056.1,INSD:EL255497.1,INSD:EH815307.1,INSD:EH 841897.1,INSD:BP597615.1,INSD:BP637834.1,INSD:ES118809.1,I NSD:ES112816.1,INSD:EL327403.1,INSD:EL012059.1,INSD:EL3249 74.1,INSD:EH842564.1,INSD:AV534031.1,INSD:ES216013.1,INSD: T43530.1,INSD:EH842517.1,INSD:EL293561.1,INSD:AV542349.1,I NSD:EL274264.1,INSD:BP571572.1,INSD:ES188276.1,INSD:EH9756 72.1,INSD:EL996973.1,INSD:EL996103.1,INSD:ES106686.1,INSD: DR291082.1,INSD:ES040435.1,INSD:BP661766.1,INSD:AV545495.1 ,INSD:ES167820.1,INSD:ES210357.1,INSD:BP834470.1,INSD:EL05 3685.1,INSD:BP582425.1,INSD:EH810990.1,INSD:EH960028.1,INS D:AV552967.1,INSD:AV526819.1,INSD:EL968034.1,INSD:EL972507 .1,INSD:BE038477.1,INSD:EH826030.1,INSD:BP821420.1,INSD:DR 291086.1,INSD:DR291044.1,INSD:DR291025.1,INSD:ES196358.1,I NSD:ES041890.1,INSD:EH826967.1,INSD:BP845607.1,INSD:AV5314 66.1,INSD:EL020378.1,INSD:AV562239.1,INSD:AV556676.1,INSD: BP572738.1,INSD:ES167578.1,INSD:BP654748.1,INSD:ES145446.1 ,INSD:AV554475.1,INSD:DR291087.1,INSD:ES172701.1,INSD:BP79 9720.1,INSD:EL291152.1,INSD:ES002738.1,INSD:AV552971.1,INS D:ES144504.1,INSD:BP829046.1,INSD:BP632937.1,INSD:BP839307 .1,INSD:BP604722.1,INSD:DR291024.1,INSD:AV798564.1,INSD:DR 374542.1,INSD:EL980712.1,INSD:EH811016.1,INSD:ES072470.1,I NSD:BP813371.1,INSD:BP850749.1,INSD:EL171086.1,INSD:DR2910 75.1,INSD:EL973496.1,INSD:EL208793.1,INSD:DR291061.1,INSD: EL058818.1,INSD:ES193116.1,INSD:EL029353.1,INSD:AV552913.1 ,INSD:BP813744.1,INSD:EL136555.1,INSD:DR290476.1,INSD:EL14 0342.1,INSD:BP829738.1,INSD:BP825014.1,INSD:ES113461.1,INS D:BP585439.1,INSD:DR290477.1,INSD:DR291039.1,INSD:ES011379 .1,INSD:EH847634.1,INSD:AV560608.1,INSD:EL229830.1,INSD:AV 564732.1,INSD:ES174606.1,INSD:EL182083.1,INSD:ES200425.1,I NSD:AV534310.1,INSD:EL970217.1,INSD:ES058717.1,INSD:DR2910 89.1,INSD:ES031950.1,INSD:EL169841.1,INSD:EH880312.1,INSD: ES186635.1,INSD:EL086301.1,INSD:ES187380.1,INSD:EL105066.1 ,INSD:AV558072.1,INSD:EL019577.1,INSD:ES123279.1,INSD:BP84 4276.1,INSD:EH812625.1,INSD:EL213188.1,INSD:DR291084.1,INS D:BP594703.1,INSD:BP656506.1,INSD:AV784649.1,INSD:ES191022 .1,INSD:DR291101.1,INSD:AV552973.1,INSD:DR291070.1,INSD:EH 921525.1,INSD:BP864097.1,INSD:EL080654.1,INSD:DR291027.1,I NSD:BP864661.1,INSD:EL326242.1,INSD:DR291092.1,INSD:EL1217 32.1,INSD:ES145357.1,INSD:BP810653.1,INSD:ES061988.1,INSD: EH809337.1,INSD:AV785940.1,INSD:EH818626.1,INSD:AV552898.1 ,INSD:EH880462.1,INSD:EL065359.1,INSD:DR291051.1,INSD:EH92 2071.1,INSD:ES214630.1,INSD:DR291042.1,INSD:CB263223.1,INS D:EH803691.1,INSD:EL013228.1,INSD:ES150257.1,INSD:BE528994 .1,INSD:EH854512.1,INSD:BP654166.1,INSD:EH897327.1,INSD:ES 183291.1,INSD:BP647482.1,INSD:DR291074.1,INSD:DR291105.1,I NSD:AI994428.1,INSD:AV542083.1,INSD:EL041210.1,INSD:AV5352 95.1,INSD:ES213094.1,INSD:BP817340.1,INSD:DR291072.1,INSD: BP833190.1,INSD:DR291077.1,INSD:EL973384.1,INSD:EL183822.1 ,INSD:DR291097.1,INSD:DR291035.1,INSD:EH923186.1,INSD:BP63 3353.1,INSD:ES197826.1,INSD:DR291100.1,INSD:EL318988.1,INS D:BP828967.1,INSD:EL969833.1,INSD:AV552919.1,INSD:AV559486 .1,INSD:DR291034.1,INSD:DR291054.1,INSD:ES211597.1,INSD:DR 291031.1,INSD:BP866277.1,INSD:EL058076.1,INSD:EL998513.1,I NSD:AV537454.1,INSD:ES084602.1,INSD:DR291081.1,INSD:BP5865 82.1,INSD:EL186598.1,INSD:DR291037.1,INSD:ES215375.1,INSD: EL322648.1,INSD:DR290475.1,INSD:EL999961.1,INSD:DR370217.1 ,INSD:H36513.1,INSD:EH861637.1,INSD:BP862376.1,INSD:EL3017 66.1,INSD:EH926818.1,INSD:AV526921.1,INSD:EL262990.1,INSD: EL980003.1,INSD:AV541686.1,INSD:ES083667.1,INSD:T43533.1,I NSD:BP838085.1,INSD:BP660643.1,INSD:ES162440.1,INSD:EL0285 46.1,INSD:ES152883.1,INSD:EL339346.1,INSD:BP851608.1,INSD: DR291076.1,INSD:EL140639.1,INSD:DR291079.1,INSD:DR291094.1 ,INSD:ES117256.1,INSD:EL214923.1,INSD:EL082081.1,INSD:DR29 1030.1,INSD:DR291073.1,INSD:EH874303.1,INSD:DR291048.1,INS D:ES211105.1,INSD:AV823645.1,INSD:BP832615.1,INSD:AV549329 .1,INSD:DR377342.1,INSD:AV535392.1,INSD:EL215727.1,INSD:EL 992275.1,INSD:EL081103.1,INSD:EL084867.1,INSD:ES151236.1,I NSD:BP845087.1,INSD:DR291090.1,INSD:DR291109.1,INSD:BP8007 29.1,INSD:DR291065.1,INSD:EH881505.1,INSD:DR291080.1,INSD: ES177199.1,INSD:EL269794.1,INSD:N37914.1,INSD:EH985687.1,I NSD:EL166538.1,INSD:EH914608.1,INSD:EL995960.1,INSD:DR2910 23.1,INSD:BP851389.1,INSD:ES155636.1,INSD:ES062691.1,INSD: ES137070.1,INSD:DR291069.1,INSD:ES113283.1,INSD:EH959562.1 ,INSD:DR291099.1,INSD:DR291104.1,INSD:ES084512.1,INSD:DR29 1106.1,INSD:DR291091.1,INSD:DR291107.1,INSD:ES101335.1,INS D:EL088524.1,INSD:EL113063.1,INSD:EL245111.1,INSD:EH859927 .1,INSD:ES084540.1,INSD:DR291059.1,INSD:DR291026.1,INSD:EL 194376.1,INSD:EH985026.1,INSD:BP647372.1,INSD:EL267272.1,I NSD:BP634783.1,INSD:ES215981.1,INSD:DR291103.1,INSD:BP6452 66.1,INSD:EH836376.1,INSD:EG521907.1,INSD:EH850332.1,INSD: BP645844.1,INSD:BP821953.1,INSD:DR291028.1,INSD:EL153579.1 ,INSD:EH982178.1,INSD:CF652963.1,INSD:EH906041.1,INSD:EG52 1906.1,INSD:EH809804.1,INSD:DR291033.1,INSD:ES197370.1,INS D:DR291063.1,INSD:BP799293.1,INSD:EL155252.1,INSD:DR291045 .1,INSD:N37913.1,INSD:ES038581.1,INSD:BP847668.1,INSD:EL23 7296.1,INSD:EL232294.1,INSD:DR291085.1,INSD:ES182532.1,INS D:EL101152.1,INSD:ES094067.1,INSD:DR291096.1,INSD:EH916851 .1,INSD:EL140505.1,INSD:CB255723.1,INSD:DR379975.1,INSD:EL 978362.1,INSD:ES190377.1,INSD:EH866638.1,INSD:EH888164.1,I NSD:BP804826.1,INSD:DR291071.1,INSD:BP864625.1,INSD:EL9927 93.1,INSD:ES140834.1,INSD:DR291060.1,INSD:DR291032.1,INSD: DR291068.1,INSD:ES153795.1,INSD:EH993859.1,INSD:CB259100.1 ,INSD:CB258740.1,INSD:DR291078.1,INSD:DR291055.1" /inference="Similar to RNA sequence,mRNA:INSD:BX824143.1,INSD:BX822969.1,INSD:BX82406 4.1,INSD:AY045846.1,INSD:AY091376.1,INSD:Z18496.1,INSD:BX8 22599.1" /db_xref="TAIR:AT3G11940" mRNA 2100..>2209 /gene="RPS5A" /locus_tag="AT3G11940" /gene_synonym="AML1" /gene_synonym="ARABIDOPSIS MINUTE-LIKE 1" /gene_synonym="ATRPS5A" /gene_synonym="MEC18.11" /gene_synonym="ribosomal protein 5A" /gene_synonym="RPS5A" /product="40S ribosomal protein S5-2" /inference="Similar to RNA sequence,EST:INSD:EL264057.1,INSD:CB257800.1,INSD:BP661979 .1,INSD:EL973496.1,INSD:EL208793.1,INSD:EL970714.1,INSD:EL 058818.1,INSD:BP585894.1,INSD:ES193116.1,INSD:EL029353.1,I NSD:AV552913.1,INSD:CB258928.1,INSD:EL136555.1,INSD:BP5747 79.1,INSD:DR290476.1,INSD:EL140342.1,INSD:ES077896.1,INSD: EH885393.1,INSD:H35945.1,INSD:EL206403.1,INSD:BP825014.1,I NSD:ES104971.1,INSD:BP617461.1,INSD:ES113461.1,INSD:BP5854 39.1,INSD:DR290477.1,INSD:EL153458.1,INSD:ES011379.1,INSD: EH847634.1,INSD:EL999042.1,INSD:BP663224.1,INSD:AV560608.1 ,INSD:EL229830.1,INSD:AV564732.1,INSD:EL336270.1,INSD:DR29 1064.1,INSD:EL233744.1,INSD:ES200425.1,INSD:ES160988.1,INS D:EL182083.1,INSD:EL300221.1,INSD:ES174606.1,INSD:AV565182 .1,INSD:AV534310.1,INSD:EL970217.1,INSD:AA712994.1,INSD:EL 102359.1,INSD:ES058717.1,INSD:ES031950.1,INSD:BP670521.1,I NSD:BP587074.1,INSD:ES200172.1,INSD:EL169841.1,INSD:ES2109 62.1,INSD:ES186635.1,INSD:EH880312.1,INSD:EL252469.1,INSD: ES187380.1,INSD:EL105066.1,INSD:EH837595.1,INSD:ES190551.1 ,INSD:ES169037.1,INSD:EL972330.1,INSD:EG508307.1,INSD:AV55 8072.1,INSD:EL019577.1,INSD:ES123279.1,INSD:DR290479.1,INS D:BP844276.1,INSD:EH812625.1,INSD:BE520183.1,INSD:DR290478 .1,INSD:EH814841.1,INSD:EL213188.1,INSD:BP584664.1,INSD:BP 594703.1,INSD:BP622644.1,INSD:BP656506.1,INSD:AV784649.1,I NSD:ES191022.1,INSD:ES215433.1,INSD:AV552973.1,INSD:EL1718 63.1,INSD:EH921525.1,INSD:EL080654.1,INSD:EL063744.1,INSD: EL193753.1,INSD:EL326242.1,INSD:ES145357.1,INSD:EL121732.1 ,INSD:EL027305.1,INSD:AV520490.1,INSD:EH879757.1,INSD:ES06 1988.1,INSD:EH893935.1,INSD:AV785940.1,INSD:EH809337.1,INS D:ES078009.1,INSD:EH818626.1,INSD:AV552898.1,INSD:EL070246 .1,INSD:EH880462.1,INSD:EL065359.1,INSD:ES127433.1,INSD:EL 972406.1,INSD:BP670932.1,INSD:BP572454.1,INSD:EH922071.1,I NSD:ES214630.1,INSD:EL195401.1,INSD:AV551959.1,INSD:BP5663 36.1,INSD:ES150257.1,INSD:EL013228.1,INSD:EH803691.1,INSD: EL237325.1,INSD:ES076214.1,INSD:EH854512.1,INSD:BP654166.1 ,INSD:CB261407.1,INSD:EH897327.1,INSD:BP629625.1,INSD:ES18 3291.1,INSD:BP647482.1,INSD:AI994428.1,INSD:AV539002.1,INS D:AV545161.1,INSD:EH821728.1,INSD:ES158978.1,INSD:ES129692 .1,INSD:EG440267.1,INSD:EL041210.1,INSD:AV535295.1,INSD:ES 213094.1,INSD:EL314195.1,INSD:EL973384.1,INSD:ES131201.1,I NSD:ES197993.1,INSD:EL183822.1,INSD:EL978525.1,INSD:DR2910 97.1,INSD:EH868174.1,INSD:EL271404.1,INSD:ES002261.1,INSD: BP633353.1,INSD:EH923186.1,INSD:EL187611.1,INSD:ES197826.1 ,INSD:EL224473.1,INSD:ES028886.1,INSD:EH914926.1,INSD:EG44 0268.1,INSD:ES117736.1,INSD:EL974223.1,INSD:ES093392.1,INS D:EL318988.1,INSD:EL969833.1,INSD:EL031787.1,INSD:BP791147 .1,INSD:ES188941.1,INSD:EL097289.1,INSD:EH832661.1,INSD:ES 211597.1,INSD:EL272851.1,INSD:BP594727.1,INSD:BP590497.1,I NSD:BP840394.1,INSD:ES083210.1,INSD:EL058076.1,INSD:EL9985 13.1,INSD:AV537454.1,INSD:ES084602.1,INSD:BP586582.1,INSD: EL186598.1,INSD:ES070764.1,INSD:ES215375.1,INSD:EL322648.1 ,INSD:EL976017.1,INSD:AV542246.1,INSD:ES210796.1,INSD:EG52 3158.1,INSD:DR290475.1,INSD:EH900717.1,INSD:EL979201.1,INS D:EL999961.1,INSD:DR370217.1,INSD:EH861637.1,INSD:AV533693 .1,INSD:DR290474.1,INSD:EL301766.1,INSD:EH980822.1,INSD:EL 262990.1,INSD:DR291049.1,INSD:ES180935.1,INSD:EL980003.1,I NSD:EL113228.1,INSD:AV541686.1,INSD:ES055662.1,INSD:ES0836 67.1,INSD:BP660643.1,INSD:ES162440.1,INSD:EL028546.1,INSD: AV552979.1,INSD:ES027641.1,INSD:ES152883.1,INSD:EL339346.1 ,INSD:AV552955.1,INSD:ES038147.1,INSD:EL140639.1,INSD:EL24 7325.1,INSD:ES165579.1,INSD:EH958234.1,INSD:T46260.1,INSD: EH985128.1,INSD:BE524712.1,INSD:AV530291.1,INSD:ES117256.1 ,INSD:EL082081.1,INSD:EL214923.1,INSD:ES063415.1,INSD:BP64 3895.1,INSD:EH874303.1,INSD:EL309705.1,INSD:EL200550.1,INS D:ES109293.1,INSD:ES211105.1,INSD:BP832615.1,INSD:EL204482 .1,INSD:AV549329.1,INSD:ES001407.1,INSD:EL086755.1,INSD:ES 167252.1,INSD:EL290441.1,INSD:DR377342.1,INSD:AV535392.1,I NSD:EL215727.1,INSD:EL081103.1,INSD:BP565337.1,INSD:EL0848 67.1,INSD:EH928597.1,INSD:ES151236.1,INSD:AV520567.1,INSD: EL167764.1,INSD:EL255497.1,INSD:DR291067.1,INSD:EH815307.1 ,INSD:EH881505.1,INSD:EH841897.1,INSD:ES177199.1,INSD:EL26 9794.1,INSD:EH985687.1,INSD:BP597615.1,INSD:BP637834.1,INS D:ES118809.1,INSD:EL166538.1,INSD:ES112816.1,INSD:EH914608 .1,INSD:EL327403.1,INSD:EL995960.1,INSD:EL012059.1,INSD:T2 2078.1,INSD:ES137070.1,INSD:ES062691.1,INSD:ES155636.1,INS D:T44658.1,INSD:EH959562.1,INSD:EL324974.1,INSD:ES113283.1 ,INSD:EH842564.1,INSD:AV534031.1,INSD:ES207499.1,INSD:ES21 6013.1,INSD:EH842517.1,INSD:EL293561.1,INSD:ES084512.1,INS D:AV542349.1,INSD:ES101335.1,INSD:EL274264.1,INSD:BP571572 .1,INSD:EL113063.1,INSD:EL088524.1,INSD:ES084540.1,INSD:ES 188276.1,INSD:EH859927.1,INSD:EL245111.1,INSD:EH975672.1,I NSD:EL996973.1,INSD:EL996103.1,INSD:EL194376.1,INSD:BP6473 72.1,INSD:EH985026.1,INSD:EL267272.1,INSD:BP634783.1,INSD: ES106686.1,INSD:BP661766.1,INSD:ES040435.1,INSD:ES215981.1 ,INSD:AV545495.1,INSD:BP645266.1,INSD:EH836376.1,INSD:EG52 1907.1,INSD:ES167820.1,INSD:ES210357.1,INSD:ES135481.1,INS D:BP645844.1,INSD:EH850332.1,INSD:DR291058.1,INSD:BP582425 .1,INSD:EH810990.1,INSD:EL153579.1,INSD:EH982178.1,INSD:EH 906041.1,INSD:EH960028.1,INSD:EH809804.1,INSD:EG521906.1,I NSD:AV552967.1,INSD:EL968034.1,INSD:ES197370.1,INSD:ES0924 37.1,INSD:EL972507.1,INSD:EL160256.1,INSD:EH826030.1,INSD: BP821420.1,INSD:EL155252.1,INSD:ES041890.1,INSD:ES196358.1 ,INSD:EH826967.1,INSD:AV531466.1,INSD:EL020378.1,INSD:AV56 2239.1,INSD:AV556676.1,INSD:ES038581.1,INSD:EL086330.1,INS D:BP572738.1,INSD:EL220825.1,INSD:ES145522.1,INSD:ES167578 .1,INSD:EL237296.1,INSD:EL232294.1,INSD:ES182532.1,INSD:BP 654748.1,INSD:ES145446.1,INSD:EL101152.1,INSD:ES094067.1,I NSD:EH916851.1,INSD:ES172701.1,INSD:EL140505.1,INSD:CB2557 23.1,INSD:DR379975.1,INSD:ES190377.1,INSD:EL978362.1,INSD: EL291152.1,INSD:EH866638.1,INSD:ES120867.1,INSD:ES002738.1 ,INSD:EH888164.1,INSD:AV552971.1,INSD:EL311252.1,INSD:ES14 4504.1,INSD:ES140834.1,INSD:BP632937.1,INSD:BP604722.1,INS D:ES153795.1,INSD:CB258740.1,INSD:CB259100.1,INSD:AV798564 .1,INSD:EH993859.1,INSD:DR374542.1,INSD:EL980712.1,INSD:EH 811016.1,INSD:ES072470.1,INSD:EL171086.1" /inference="Similar to RNA sequence,mRNA:INSD:AY091376.1,INSD:AY086938.1,INSD:BX82292 5.1" /db_xref="TAIR:AT3G11940" primer complement(2327..2344) /label="JS837" CDS 2440..3450 /vntifkey="4" /label="Sm/Sp no DraIII" mutation 3417 /vntifkey="62" /label="G to A" ORIGIN 1 GTTACCGGAT AAGGCGCAGC GGTCGGGCTG AACGGGGGGT TCGTGCACAC AGCCCAGCTT 61 GGAGCGAACG ACCTACACCG AACTGAGATA CCTACAGCGT GAGCTATGAG AAAGCGCCAC 121 GCTTCCCGAA GGGAGAAAGG CGGACAGGTA TCCGGTAAGC GGCAGGGTCG GAACAGGAGA 181 GCGCACGAGG GAGCTTCCAG GGGGAAACGC CTGGTATCTT TATAGTCCTG TCGGGTTTCG 241 CCACCTCTGA CTTGAGCGTC GATTTTTGTG ATGCTCGTCA GGGGGGCGGA GCCTATGGAA 301 AAACGCCAGC AACGCGGCCT TTTTACGGTT CCTGGCCTTT TGCTGGCCTT TTGCTCACAT 361 GTTCTTTCCT GCGTTATCCC CTGATTCTGT GGATAACCGT ATTACCGCCT TTGAGTGAGC 421 TGATACCGCT CGCCGCAGCC GAACGACCGA GCGCAGCGAG TCAGTGAGCG AGGAAGCGGA 481 AGAGCGCCCA ATACGCAAAC CGCCTCTCCC CGCGCGTTGG CCGATTCATT AATCACTCTG 541 TGGTCTCAGG AGCTCAACTT TTGATTCGCT ATTTGCAGTG CACCTGTGGC GTTCATCACA 601 TCTTTTGTGA CACTGTTTGC ACTGGTCATT GCTATTACAA AGGACCTTCC TGATGTTGAA 661 GGAGATCGAA AGTAAGTAAC TGCACGCATA ACCATTTTCT TTCCGCTCTT TGGCTCAATC 721 CATTTGACAG TCAAAGACAA TGTTTAACCA GCTCCGTTTG ATATATTGTC TTTATGTGTT 781 TGTTCAAGCA TGTTTAGTTA ATCATGCCTT TGATTGATCT TGAATAGGTT CCAAATATCA 841 ACCCTGGCAA CAAAACTTGG AGTGAGAAAC ATTGCATTCC TCGGTTCTGG ACTTCTGCTA 901 GTAAATTATG TTTCAGCCAT ATCACTAGCT TTCTACATGC CTCAGGTGAA TTCATCTATT 961 TCCGTCTTAA CTATTTCGGT TAATTAAAGC ACGAACACCA TTACTGCATG TAGAAGCTTG 1021 ATAAACTATC GCCACCAATT TATTTTTGTT GCGATATTGT TACTTTCCTC AGTATGCAGC 1081 TTTGAAAAGA CCAACCCTCT TATCCTTTAA CAATGAACAG GTTTTTAGAG GTAGCTTGAT 1141 GATTCCTGCA CATGTGATCT TGGCTTCAGG CTTAATTTTC CAGGTAAAGC ATTATGAGAT 1201 ACTCTTATAT CTCTTACATA CTTTTGAGAT AATGCACAAG AACTTCATAA CTATATGCTT 1261 TAGTTTCTGC ATTTGACACT GCCAAATTCA TTAATCTCTA ATATCTTTGT TGTTGATCTT 1321 TGGTAGACAT GGGTACTAGA AAAAGCAAAC TACACCAAGG TAAAATACTT TTGTACAAAC 1381 ATAAACTCGT TATCACGGAA CATCAATGGA GTGTATATCT AACGGAGTGT AGAAACATTT 1441 GATTATTGCA GGAAGCTATC TCAGGATATT ATCGGTTTAT ATGGAATCTC TTCTACGCAG 1501 AGTATCTGTT ATTCCCCTTC CTCTAGCTTT CAATTTCATG GTGAGGATAT GCAGTTTTCT 1561 TTGTATATCA TTCTTCTTCT TCTTTGTAGC TTGGAGTCAA AATCGGTTCC TTCATGTACA 1621 TACATCAAGG ATATGTCCTT CTGAATTTTT ATATCTTGCA ATAAAAATGC TTGTACCAAT 1681 TGAAACACCA GCTTTTTGAG TTCTATGATC ACTGACTTGG TTCTAACCAA AAAAAAAAAA 1741 ATGTTTAATT TACATATCTA AAAGTAGGTT TAGGGAAACC TAAACAGTAA AATATTTGTA 1801 TATTATTCGA ATTTCACTCA TCATAAAAAC TTAAATTGCA CCATAAAATT TTGTTTTACT 1861 ATTAATGATG TAATTTGTGT AACTTAAGAT AAAAATAATA TTCCGTAAGT TAACCGGCTA 1921 AAACCACGTA TAAACCAGGG AACCTGTTAA ACCGGTTCTT TACTGGATAA AGAAATGAAA 1981 GCCCATGTAG ACAGCTCCAT TAGAGCCCAA ACCCTAAATT TCTCATCTAT ATAAAAGGAG 2041 TGACATTAGG GTTTTTGTTC GTCCTCTTAA AGCTTCTCGT TTTCTCTGCC GTCTCTCTCA 2101 TTCGCGCGAC GCAAACGATC TTCAGGTGAT CTTCTTTCTC CAAATCCTCT CTCATAACTC 2161 TGATTTCGTA CTTGTGTATT TGAGCTCACG CTCTGTTTCT CTCACCACAC CATTGAGACC 2221 ACGAAGTGGC TCTTCAGTGG ACGAAAGGGC CTCGTGATAC GCCTATTTTT ATAGGTTAAT 2281 GTCATGATAA TAATGGTTTC TTAGACGTCA GGTGGCACTT TTCGGGGAAA TGTGCGCGGA 2341 ACCCCTATTT GTTTATTTTT CTAAATACAT TCAAATATGT ATCCGCTCAT GAGACAATAA 2401 CCCTGATAAA TGCTTCAATA ATATTGAAAA AGGAAGAGTA TGCGCTCACG CAACTGGTCC 2461 AGAACCTTGA CCGAACGCAG CGGTGGTAAC GGCGCAGTGG CGGTTTTCAT GGCTTGTTAT 2521 GACTGTTTTT TTGGGGTACA GTCTATGCCT CGGGCATCCA AGCAGCAAGC GCGTTACGCC 2581 GTGGGTCGAT GTTTGATGTT ATGGAGCAGC AACGATGTTA CGCAGCAGGG CAGTCGCCCT 2641 AAAACAAAGT TAAACATCAT GAGGGAAGCG GTGATCGCCG AAGTATCGAC TCAACTATCA 2701 GAGGTAGTTG GCGTCATCGA GCGCCATCTC GAACCGACGT TGCTGGCCGT ACATTTGTAC 2761 GGCTCCGCAG TGGATGGCGG CCTGAAGCCA CACAGCGATA TTGATTTGCT GGTTACGGTG 2821 ACCGTAAGGC TTGATGAAAC AACGCGGCGA GCTTTGATCA ACGACCTTTT GGAAACTTCG 2881 GCTTCCCCTG GAGAGAGCGA GATTCTCCGC GCTGTAGAAG TCACCATTGT TGTGCACGAC 2941 GACATCATTC CGTGGCGTTA TCCAGCTAAG CGCGAACTGC AATTTGGAGA ATGGCAGCGC 3001 AATGACATTC TTGCAGGTAT CTTCGAGCCA GCCACGATCG ACATTGATCT GGCTATCTTG 3061 CTGACAAAAG CAAGAGAACA TAGCGTTGCC TTGGTAGGTC CAGCGGCGGA GGAACTCTTT 3121 GATCCGGTTC CTGAACAGGA TCTATTTGAG GCGCTAAATG AAACCTTAAC GCTATGGAAC 3181 TCGCCGCCCG ACTGGGCTGG CGATGAGCGA AATGTAGTGC TTACGTTGTC CCGCATTTGG 3241 TACAGCGCAG TAACCGGCAA AATCGCGCCG AAGGATGTCG CTGCCGACTG GGCAATGGAG 3301 CGCCTGCCGG CCCAGTATCA GCCCGTCATA CTTGAAGCTA GACAGGCTTA TCTTGGACAA 3361 GAAGAAGATC GCTTGGCCTC GCGCGCAGAT CAGTTGGAAG AATTTGTCCA TTACGTAAAA 3421 GGCGAGATCA CCAAGGTAGT CGGCAAATAA CTGTCAGACC AAGTTTACTC ATATATACTT 3481 TAGATTGATT TAAAACTTCA TTTTTAATTT AAAAGGATCT AGGTGAAGAT CCTTTTTGAT 3541 AATCTCATGA CCAAAATCCC TTAACGTGAG TTTTCGTTCC ACTGAGCGTC AGACCCCGTA 3601 GAAAAGATCA AAGGATCTTC TTGAGATCCT TTTTTTCTGC GCGTAATCTG CTGCTTGCAA 3661 ACAAAAAAAC CACCGCTACC AGCGGTGGTT TGTTTGCCGG ATCAAGAGCT ACCAACTCTT 3721 TTTCCGAAGG TAACTGGCTT CAGCAGAGCG CAGATACCAA ATACTGTCCT TCTAGTGTAG 3781 CCGTAGTTAG GCCACCACTT CAAGAACTCT GTAGCACCGC CTACATACCT CGCTCTGCTA 3841 ATCCTGTTAC CAGTGGCTGC TGCCAGTGGC GATAAGTCGT GTCTTACCGG GTTGGACTCA 3901 AGACGATA //